Un ou de Pasqua al tràiler de Captain Marvel confirma que la pel·lícula implicarà The Avengers 'Project PEGASUS: un lligam subtil als Infinity Stones. El capità Marvel sembla servir de precuela a tota la franquícia de Avengers, revelant una aventura mai antiga de Nick Fury i Phil Coulson. Sembla ser el motiu pel qual Fury es va fer creient en els superherois, amb el capità Marvel com a inspiració per a tota la iniciativa dels venjadors. Però sembla que les connexions poden funcionar molt més profundament.
El projecte PEGASUS està aixecat directament dels còmics, on es va concebre com a base científica a les muntanyes Adirondack. Al principi, tenia com a objectiu supervisar la investigació sobre formes alternatives d'energia, però a poc a poc es va convertir en un centre per a algunes de les tecnologies més avançades del món. La versió MCU es va fer referència per primera vegada a Iron Man 2, que va revelar que Howard Stark havia estat involucrat en el projecte abans de la seva mort el 1991. Finalment es va veure a la gran pantalla de The Avengers el 2012, quan Loki es va infiltrar en les seves instal·lacions. Desert de Mojave.
El segon tràiler de Captain Marvel finalment ha confirmat que Project PEGASUS apareixerà a la pel·lícula. Una de les escenes del tràiler veu que Nick Fury i Carol Danvers roben un Quinjet, un amb un logo PEGASUS a l'ala. Sembla que Fury ha dut el capità Marvel a una base PEGASUS, cosa que té sentit; el capità marí del capità Marvel va mostrar a un Quinjet volant a l’espai i, fins i tot, els Quinjets moderns no tenen aquesta capacitat. Però un Quinjet PEGASUS, probablement un disseny més rar, construït com a resultat d'una associació entre SHIELD i la NASA, podria fer-ho.
No obstant això, la referència PEGASUS és important per un altre motiu. És important recordar que, a The Avengers, la base PEGASUS al desert de Mojave era el lloc on SHIELD estava investigant el poder del Tesseract. Atès que el desert de Mojave es troba principalment al sud de Califòrnia i el capità Marvel té lloc a Los Angeles (mentre que a la Terra), és molt probable que es tracti del mateix equipament. Howard Stark va ser recuperat per la pedra espacial abans de la seva mort; treballava amb PEGASUS, per la qual cosa és possible que estudiés el Tesseract allà, i que romangués a la instal·lació del desert del Mojave fins a l'arribada de Loki a la pel·lícula The Avengers.
És interessant assenyalar que Talos, el capità Marvel de Ben Mendelsohn, el líder de la guerra de Skrull que ha utilitzat els seus poders de canvi de formes per infiltrar-se a SHIELD, sembla dirigir un equip de seguretat de la base PEGASUS. És només una coincidència - o els Skrulls han orientat aquesta instal·lació específica per un motiu? El Tesseract pot ser realment una part important de la trama del capità Marvel; potser els Skrulls han après que la Pedra Espacial es troba a la Terra i que tota la seva invasió és realment un intent d’adquirir-la. Hi ha un precedent de còmics per a aquesta idea; a l'esdeveniment Secret Invasion del 2007, els Skrulls van centrar una gran quantitat d'esforços en la captura de la tecnologia avançada guardada a PEGASUS, i podrien tenir el mateix motiu aquí. Si és així, i si Tesseract fa un paper en aquesta pel·lícula, el capità Marvel no serà només una història prèvia a la franquícia Avengers; en canvi, configurarà l'escena per a tot el MCU.
